站房分为主站房（北站房），次站房（南站房）和站台雨棚。

站房主体建筑面积为10132.1㎡，主站房位于潮州方向，次 潮汕站南站房(5张) 站房位于汕头方向。南北站房通过旅客地道连通，每一边都有候车大厅和售票厅，旅客可在南北两侧同时上车。旅客到达潮汕站后如需乘坐公交车、专线大巴、私家车请从北出站口出站；乘坐出租车、私家车则从南出站口出站。潮汕站“斜屋面”、“虎头墙”等设计元素，具有浓郁的潮州地方特色。其中北站房候车厅屋面结构采用钢网架，立面装饰主要采用花岗石石材幕墙和玻璃幕墙，看上去厚重朴实。

潮汕站是是梅汕客运专线的终点站，也是厦深铁路汕头联络线的接轨站。

该站是是厦深铁路沿线大站之一，在杭深线上行方向距离上海虹桥站1318公里，杭州东站1159公里， 到厦门北站——1.5小时左右的小时车程，最短1小时21分钟， 到莆田站——2.5小时左右的车程，最短2小时17分钟，福州站——3.5小时左右的车程，最短3小时17分钟；厦深铁路与已建成的福厦铁路、向莆高速铁路、温福铁路、甬台温、杭甬等铁路相连，贯通东南沿海铁路线。