巨蜥属包含以下物种：
1
刺尾巨蜥
V. acanthurus
红刺尾巨蜥
V. a. acanthurus
黄刺尾巨蜥
V. a. brachyurus
岛屿刺尾巨蜥
V. a. insulanicus
2
非洲巨蜥
V. albigularis
南非白喉巨蜥
V. a. albigularis
安哥拉白喉巨蜥
V. a. angolensis
黑喉巨蜥
V. a. ionidesi
3
孔雀巨蜥
V. auffenbergi
4
白氏巨蜥
V. baritji
5
黑珍珠巨蜥
V. beccarii
6
孟加拉巨蜥
V. bengalensis
孟加拉巨蜥指名亚种
V. b. bengalensis
暗色巨蜥（孟加拉巨蜥东部亚种）
V. b. nebulosus
7
金点树巨蜥
V. boehmei
8
弗格森岛巨蜥
V. bogerti
9
短尾巨蜥
V. brevicauda
10
布氏侏儒巨蜥
V. bushi
11
V. caerulivirens
12
尾纹巨蜥
V. caudolineatus
13
斯兰安汶树巨蜥
V. cerambonensis
14
金头泽巨蜥
V. cumingi
15
蓝尾巨蜥
V. doreanus
16
杜氏巨蜥
V. dumerilii
17
沙生巨蜥
V. eremius
18
草原巨蜥
V. exanthematicus
19
芬西树巨蜥
V. finschi
20
黄巨蜥
V. flavescens
21
眼斑巨蜥
V. giganteus
22
吉兰巨蜥
V. gilleni
23
长尾岩巨蜥
V. glauerti
24
宽足巨蜥
V. glebopalma
25
砂巨蜥
V. gouldii
V. g. horni
V. g. rubidus
26
沙漠巨蜥
V. griseus
西部沙漠巨蜥
V. g. griseus
东部沙漠巨蜥
V. g. caspius
印度沙漠巨蜥
V. g. koniecznyi
27
红树巨蜥
V. indicus
28
卡氏巨蜥
V. jobiensis
29
伦内尔岛树巨蜥
V. juxtindicus
30
蓝鼻巨蜥
V. keithhornei
31
国王巨蜥
V. kingorum
32
科莫多龙
V. komodoensis
33
祖母绿树巨蜥
V. kordensis
34
利龙巨蜥
V. lirungensis
35
班乃巨蜥
V. mabitang
36
蓝树巨蜥
V. macraei
37
大理石水巨蜥
V. marmoratus
38
黄树巨蜥
V. melinus
39
莫顿巨蜥
V. mertensi
40
米卓氏水巨蜥
V. mitchelli
41
尼罗巨蜥
V. niloticus
42
白头水巨蜥
V. nuchalis
43
葛氏巨蜥
V. olivaceus
44
华丽巨蜥
V. ornatus
45
百眼巨蜥
V. panoptes
V. p. panoptes
V. p. horni
V. p. rubidus
46
皮尔巴拉岩巨蜥
V. pilbarensis
47
翡翠巨蜥
V. prasinus
48
北部钝刺巨蜥
V. primordius
49
古巨蜥（已灭绝）
V. priscus
50
昆特氏树巨蜥
V. rainerguentheri
51
瑞氏树巨蜥
V. reisingeri
52
黑砂巨蜥
V. rosenbergi
53
粗脖巨蜥
V. rudicollis
54
萨氏巨蜥
V. salvadorii
55
泽巨蜥
V. salvator
亚洲水巨蜥
V. s. salvator
安达曼水巨蜥
V. s. andamanensis
双带水巨蜥
V. s. bivittatus
黑水巨蜥
V. s. komaini
巨斑泽巨蜥
V. s. macromaculatus
56
带壮树巨蜥
V. scalaris
57
锈色巨蜥
V. semiremex
58
史宾沙巨蜥
V. spenceri
59
所罗门龙骨巨蜥
V. spinulosus
60
史东巨蜥
V. storri
东部史东巨蜥
V. s. storri
西部史东巨蜥
V. s. ocreatus
61
罗素岛巨蜥
V. telenesetes
62
帝汶巨蜥
V. timorensis
63
汤加水巨蜥
V. togianus
64
黑头巨蜥
V. tristis
雀斑巨蜥
V. t. orientalis
65
饰纹巨蜥
V. varius
66
也门巨蜥
V. yemenensis
67
三色巨蜥
V. yuwonoi
68
银树巨蜥